MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Frankia alni ACN14a chromosome

Total Repeats: 201701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008278	GGA	2	6	468	473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219506
2	NC_008278	GCA	2	6	549	554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219506
3	NC_008278	CGC	2	6	612	617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219506
4	NC_008278	CCGG	2	8	771	778	0 %	0 %	50 %	50 %	111219506
5	NC_008278	CGG	2	6	789	794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219506
6	NC_008278	CGC	2	6	797	802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219506
7	NC_008278	GCG	2	6	836	841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219506
8	NC_008278	CGG	3	9	842	850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219506
9	NC_008278	CCGG	2	8	854	861	0 %	0 %	50 %	50 %	111219506
10	NC_008278	CGGG	2	8	862	869	0 %	0 %	75 %	25 %	111219506
11	NC_008278	GC	3	6	878	883	0 %	0 %	50 %	50 %	111219506
12	NC_008278	CCG	2	6	914	919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219506
13	NC_008278	CCG	2	6	928	933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219506
14	NC_008278	GGGGC	2	10	943	952	0 %	0 %	80 %	20 %	111219506
15	NC_008278	CGC	2	6	963	968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219506
16	NC_008278	CGC	3	9	1059	1067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219506
17	NC_008278	GTT	2	6	1107	1112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111219506
18	NC_008278	CTG	2	6	1147	1152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219506
19	NC_008278	GGA	2	6	1215	1220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219506
20	NC_008278	TCA	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111219506
21	NC_008278	GAC	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219506
22	NC_008278	CAG	2	6	1261	1266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219506
23	NC_008278	GAC	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219506
24	NC_008278	AGG	2	6	1346	1351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219506
25	NC_008278	TTC	2	6	1354	1359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111219506
26	NC_008278	ACG	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219506
27	NC_008278	TCA	2	6	1400	1405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111219506
28	NC_008278	AGC	2	6	1424	1429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219506
29	NC_008278	GGA	2	6	1440	1445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219506
30	NC_008278	TGA	2	6	1475	1480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111219506
31	NC_008278	CCG	2	6	1492	1497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219506
32	NC_008278	GAA	2	6	1527	1532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111219506
33	NC_008278	GCC	2	6	1534	1539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219506
34	NC_008278	GCC	2	6	1557	1562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219506
35	NC_008278	TGC	2	6	1691	1696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219506
36	NC_008278	GCC	2	6	1738	1743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219506
37	NC_008278	GAC	2	6	1783	1788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219506
38	NC_008278	GACC	2	8	1860	1867	25 %	0 %	25 %	50 %	111219506
39	NC_008278	CGG	2	6	1896	1901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219506
40	NC_008278	GC	3	6	1962	1967	0 %	0 %	50 %	50 %	111219506
41	NC_008278	CGGG	2	8	2095	2102	0 %	0 %	75 %	25 %	111219507
42	NC_008278	ACCG	2	8	2104	2111	25 %	0 %	25 %	50 %	111219507
43	NC_008278	CGC	2	6	2148	2153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219507
44	NC_008278	CCG	2	6	2204	2209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219507
45	NC_008278	GCG	2	6	2260	2265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219507
46	NC_008278	GTGG	2	8	2295	2302	0 %	25 %	75 %	0 %	111219507
47	NC_008278	CGGC	2	8	2312	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	111219507
48	NC_008278	GGT	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111219507
49	NC_008278	AGG	2	6	2906	2911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219508
50	NC_008278	CCGC	2	8	2968	2975	0 %	0 %	25 %	75 %	111219508
51	NC_008278	GCCG	2	8	2986	2993	0 %	0 %	50 %	50 %	111219508
52	NC_008278	CCT	2	6	3020	3025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111219508
53	NC_008278	CGC	2	6	3056	3061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219508
54	NC_008278	CTACGA	2	12	3062	3073	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	111219508
55	NC_008278	GCC	2	6	3078	3083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219508
56	NC_008278	GGA	2	6	3110	3115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219508
57	NC_008278	GCT	2	6	3140	3145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219508
58	NC_008278	GCCG	2	8	3167	3174	0 %	0 %	50 %	50 %	111219508
59	NC_008278	TGC	2	6	3247	3252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219508
60	NC_008278	GAC	2	6	3258	3263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219508
61	NC_008278	C	6	6	3285	3290	0 %	0 %	0 %	100 %	111219508
62	NC_008278	CGA	2	6	3359	3364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219508
63	NC_008278	GATCGA	2	12	3392	3403	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	111219508
64	NC_008278	ACCCTC	2	12	3411	3422	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	111219508
65	NC_008278	CGAC	2	8	3427	3434	25 %	0 %	25 %	50 %	111219508
66	NC_008278	GAC	2	6	3474	3479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219508
67	NC_008278	CCG	2	6	3481	3486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219508
68	NC_008278	CGG	2	6	3499	3504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219508
69	NC_008278	GCT	2	6	3539	3544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219508
70	NC_008278	GAC	2	6	3650	3655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219508
71	NC_008278	GCT	2	6	3662	3667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219508
72	NC_008278	GCT	2	6	3695	3700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219508
73	NC_008278	AGG	2	6	3748	3753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219508
74	NC_008278	TGG	2	6	3772	3777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111219508
75	NC_008278	ACC	2	6	3817	3822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111219508
76	NC_008278	CGG	2	6	3842	3847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219508
77	NC_008278	ACG	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219508
78	NC_008278	CGC	2	6	3998	4003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219508
79	NC_008278	CGA	3	9	4034	4042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219508
80	NC_008278	CACC	2	8	4107	4114	25 %	0 %	0 %	75 %	111219509
81	NC_008278	GGTC	2	8	4182	4189	0 %	25 %	50 %	25 %	111219509
82	NC_008278	GCCA	2	8	4246	4253	25 %	0 %	25 %	50 %	111219509
83	NC_008278	C	6	6	4271	4276	0 %	0 %	0 %	100 %	111219509
84	NC_008278	GTG	2	6	4303	4308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111219509
85	NC_008278	CGTG	2	8	4320	4327	0 %	25 %	50 %	25 %	111219509
86	NC_008278	TGG	2	6	4343	4348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111219509
87	NC_008278	GGGC	2	8	4366	4373	0 %	0 %	75 %	25 %	111219509
88	NC_008278	GCT	2	6	4428	4433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219509
89	NC_008278	GGA	2	6	4455	4460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219509
90	NC_008278	CGG	2	6	4484	4489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219509
91	NC_008278	CGA	2	6	4506	4511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219509
92	NC_008278	TCG	2	6	4517	4522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219509
93	NC_008278	AGC	2	6	4574	4579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219509
94	NC_008278	CTG	2	6	4588	4593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219509
95	NC_008278	CGG	2	6	4612	4617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219509
96	NC_008278	CGG	2	6	4620	4625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219509
97	NC_008278	GCT	2	6	4686	4691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219509
98	NC_008278	CCGC	2	8	4694	4701	0 %	0 %	25 %	75 %	111219509
99	NC_008278	TCG	2	6	4709	4714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219509
100	NC_008278	GC	3	6	4760	4765	0 %	0 %	50 %	50 %	111219509
101	NC_008278	GAG	2	6	4846	4851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219509
102	NC_008278	TGG	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111219509
103	NC_008278	GCCC	2	8	4876	4883	0 %	0 %	25 %	75 %	111219509
104	NC_008278	GAC	2	6	4927	4932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219509
105	NC_008278	CTG	3	9	4933	4941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219509
106	NC_008278	GC	3	6	4960	4965	0 %	0 %	50 %	50 %	111219509
107	NC_008278	TCGC	2	8	4993	5000	0 %	25 %	25 %	50 %	111219509
108	NC_008278	CGA	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219509
109	NC_008278	GAC	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219509
110	NC_008278	TCG	2	6	5120	5125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219509
111	NC_008278	CCG	3	9	5150	5158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219509
112	NC_008278	GCCG	2	8	5172	5179	0 %	0 %	50 %	50 %	111219509
113	NC_008278	CGT	2	6	5199	5204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219509
114	NC_008278	CGG	2	6	5207	5212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219509
115	NC_008278	CCT	2	6	5228	5233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111219509
116	NC_008278	CGC	2	6	5566	5571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219510
117	NC_008278	GCT	2	6	5623	5628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219510
118	NC_008278	CGC	2	6	5629	5634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219510
119	NC_008278	GC	3	6	5633	5638	0 %	0 %	50 %	50 %	111219510
120	NC_008278	CGA	2	6	5656	5661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219510
121	NC_008278	TCG	2	6	5691	5696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219510
122	NC_008278	GTC	2	6	5843	5848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219510
123	NC_008278	GGC	2	6	5886	5891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219510
124	NC_008278	CCG	2	6	5907	5912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219510
125	NC_008278	CG	3	6	5922	5927	0 %	0 %	50 %	50 %	111219510
126	NC_008278	GGC	2	6	6009	6014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219511
127	NC_008278	CCGGC	2	10	6028	6037	0 %	0 %	40 %	60 %	111219511
128	NC_008278	GC	3	6	6043	6048	0 %	0 %	50 %	50 %	111219511
129	NC_008278	CCG	2	6	6076	6081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219511
130	NC_008278	CGGG	2	8	6165	6172	0 %	0 %	75 %	25 %	111219511
131	NC_008278	TGG	2	6	6351	6356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111219512
132	NC_008278	CGC	2	6	6383	6388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219512
133	NC_008278	GGT	2	6	6505	6510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111219512
134	NC_008278	CGT	2	6	6589	6594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219512
135	NC_008278	GCAT	2	8	6621	6628	25 %	25 %	25 %	25 %	111219512
136	NC_008278	GAC	2	6	6664	6669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219512
137	NC_008278	CGGG	2	8	6678	6685	0 %	0 %	75 %	25 %	111219512
138	NC_008278	CGGCGT	2	12	6727	6738	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111219512
139	NC_008278	CGT	2	6	6742	6747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219512
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142	NC_008278	GCG	2	6	6830	6835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219512
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154	NC_008278	GGCG	2	8	7303	7310	0 %	0 %	75 %	25 %	111219512
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168	NC_008278	CTG	2	6	7937	7942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219512
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261	NC_008278	GCC	2	6	11289	11294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219514
262	NC_008278	CGG	2	6	11310	11315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219514
263	NC_008278	GCC	2	6	11326	11331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219514
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266	NC_008278	GCC	2	6	11347	11352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219514
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275	NC_008278	CGGGG	2	10	11469	11478	0 %	0 %	80 %	20 %	111219514
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496	NC_008278	AGCG	2	8	20240	20247	25 %	0 %	50 %	25 %	111219527
497	NC_008278	CGGC	2	8	20260	20267	0 %	0 %	50 %	50 %	111219527
498	NC_008278	GCG	2	6	20271	20276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219527
499	NC_008278	CCG	2	6	20284	20289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219527
500	NC_008278	GTA	2	6	20298	20303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111219527

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